Reducción de redes de regulación en base a criterios dinámicos

Ponente(s): Edgardo Galán Vásquez, Ernesto Pérez Rueda Edgardo Ugalde

Las redes de regulación genética, la cuales describen las interacciones entre un conjunto de proteínas denominadas factores de transcripción y un conjunto de genes regulados, son modeladas principalmente por medio de modelos Booleanos y por modelos de ecuaciones diferenciales. Los primeros consisten de variables discretas y tiempos discretos, mientras que los segundos consisten de variables continuas y tiempos continuos. En un trabajo previo, se introdujo y se estudió una clase de modelos que consisten en una red de unidades cuyos estados individuales son cuantificados por variables continuas, variables cuya evolución sigue una dinámica contractiva a trozos en tiempos discretos. El carácter disipativo e interdependiente de la dinámica de estas redes, hace posible en principio una reducción en el tamaño de la descripción del sistema. Adicionalmente, estos modelos han demostrado que contienen un conjunto de vértices denominando dominantes, sobre el que se puede actuar de modo que la dinámica de toda la red sigue una trayectoria deseada. De manera que utilizamos este tipo de modelos para desarrollar un algoritmo que permite reducir una red a partir de sus vértices dominantes, por medio de iteraciones continuas, el cual fue probado en circuitos simples y en redes biológicas descritas previamente.