Reconociendo la recombinación de SARS-CoV-2 mediante TDA

Ponente(s): Yesenia Villicaña Molina

En los seres vivos y otros sistemas biológicos, la información genética no siempre se transmite de la misma manera. En muchos casos, pasa verticalmente, es decir, de una generación a la siguiente, de padres a hijos. Sin embargo, también puede transmitirse horizontalmente, lo que ocurre cuando el material genético se intercambia entre organismos que no están emparentados, incluso de especies diferentes. La transferencia vertical suele representarse con árboles filogenéticos. Sin embargo, cuando ocurre transferencia horizontal, la historia evolutiva deja de seguir una estructura de árbol: aparecen ciclos y se requiere trabajar con redes en lugar de árboles. Uno de los mecanismos comunes de transferencia horizontal es la recombinación. Esto sucede, por ejemplo, cuando dos virus diferentes infectan al mismo tiempo una célula huésped y su material genético se mezcla, originando un nuevo genoma viral que contiene fragmentos de ambos virus. En esta plática veremos cómo el Análisis Topológico de Datos (TDA, por sus siglas en inglés) puede ayudarnos a identificar eventos de recombinación genética en SARS-CoV-2, utilizando bases de datos públicas de este virus, debido a la gran cantidad de información disponible por su relevancia mundial