Enfoques comparativos en levaduras para estudiar procesos fundamentales: retos y oportunidades de interacción.

Autor: Lina Riego Ruíz
Coautor(es): David Iván Hernández Granados Hugo Cabrera Ibarra
Para una gran variedad de organismos, muestras biológicas y poblaciones contamos actualmente con una gran colección de datos obtenidos de forma masiva (p.e.: genomas, transcriptomas y proteomas). Basándonos en esta información disponible en las bases de datos y usando enfoques comparativos podemos estudiar tanto las semejanzas y las diferencias entre los organismos, así como la conservación y evolución de los genes, genomas o los distintos procesos celulares. Aunque existen más de 1000 genomas secuenciados de organismos hemiascomicetes, no en todos los organismos se han desarrollado las suficientes herramientas moleculares para poder estudiar, de manera funcional, los distintos procesos. Y menos aún se han desarrollado herramientas matemáticas y de análisis de datos que nos permitan entender similitudes y diferencias en algunos de los procesos biológicos de estos organismos. Abordaremos deade un panorama general cómo hemos usado en el laboratorio herramientas de genómica funcional y comparativa para entender un proceso fundamental de las células, el metabolismo de nitrógeno. Nos enfocaremos en particular algunas ideas que tenemos para identificar y estudiar RNAs largos no codificantes en levaduras. Finalmente se plantearán algunas áreas de oportunidad entre matemáticas y biología que pueden conjuntar los enfoques experimentales y de bioinformática que tenemos disponibles para la reconstrucción de redes, la identificación de procesos biológicos y sitios de unión de factores de transcripción, entre otros.