Grafos y ARN

Ponente(s): Hugo Cabrera Ibarra, David Iván Hernández Granados
Una forma de estudiar la estructura del ARN es mediante el uso de grafos, esto dado que el ARN puede plegarse sobre sí mismo para formar segmentos unidos a hidrógenos de diversas maneras en lo que es conocido como estructura secundaria de ARN. Representar esta estructura secundaria mediante grafos ha sido de gran utilidad en el análisis estructural del ARN ya que dichos modelos permiten describir las unidades modulares recurrentes del ARN, muestrear su espacio de plegamiento y aplicar los aspectos combinatorios para diseñar nuevo ARN. Por ello en esta plática nos enfocaremos en analizar algunas cadenas de ARN asociando un grafo con el fin de mostrar cómo se hace dicha asociación, lo cual puede servir para estudiar su relación funcional, clasificarlas y quizá generar predicciones. - G. F. Joyce, In vitro evolution of nucleic acids, Curr. Opin. Struct. Biol. 4 (1994), 331-336 - S. Tamar, Adventures with RNA graphs, Methods (2018), ISSN 1046-2023.